植物の根系ドローイング1,180点

• Wageningen University & Research のデジタルコレクションで、植物の根のドローイング1,180点を種・資料集単位で探せる
• 資料は 中部ヨーロッパの草地植物、畑地雑草と栽培植物、さまざまな生息環境の植物の根、森林の樹木・低木、温帯の栽培植物などの下位コレクションに分かれている
• 一覧は現在 1〜100番のレコードを表示しており、全体の閲覧は12ページまで続く
• 最初のページの項目は Abies alba、Acer pseudoplatanus、Allium cepa、Alnus glutinosa、Arabidopsis thaliana のように 植物の学名を中心に整理されている
• 同じ学名が複数回繰り返されており、1種について 複数のドローイングやレコードが存在することが分かる

---

Root System Drawings コレクションの探索

• Wageningen University & Research のデジタルコレクションで Root System Drawings コレクションを探索できる
• 全レコードは 1,180点で、現在の画面は Records 1-100 of 1,180 の状態
• ページネーションは1ページ目が現在選択されており、2、3、…、12ページへと続く

下位コレクションごとの規模

• wurzelatlas mitteleuropaeischer gruenlandpflanzen, band 2/1: pteridophyta und dicotyledoneae: 360点
• wurzelatlas : mitteleuropaeischer ackerunkraeuter und kulturpflanzen: 210点
• bewurzelung von pflanzen in verschiedenen lebensraumen (stapfia 49)/field/subcol/mode/exact/conn/and): 189点
• wurzelatlas mitteleuropaischer waldbaume und straucher: 178点
• wurzelatlas mitteleuropaeischer gruenlandpflanzen, band 1: monocotyledoneae: 152点
• wurzelatlas der kulturpflanzen gemassigter gebiete mit arten des feldgemusebaues: 90点

最初のページの項目例

• 最初の100件のレコードは 学名をタイトルとして使用している
• 序盤の項目には次の植物が含まれる
  • Abies alba
  • Acanthosicyos horridus
  • Acer campestre
  • Achillea millefolium
  • Allium cepa
  • Arabidopsis thaliana

重複レコードと探索方法

• 一部の学名は 複数のレコードとして繰り返されている
  • Abies alba は最初の3件のレコードに表示される
  • Acer pseudoplatanus は7〜9番のレコードに表示される
  • Alnus glutinosa は52〜54番のレコードに表示される
• 一覧には並び替えや1ページあたりの表示件数を調整できる 探索UI が含まれている

[GN⁺]

Hacker News のコメント

• 本当に興味深くて素晴らしい。庭仕事をするなら、よくある植物や雑草の根系を調べてみるとよい
  ヒルガオ: https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/193/rec/1 白く太い地下茎は深さ約10cmにあるが、実際の根ははるかに深くまで伸びており、この例では2.2mまで達している
  スギナ: https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/753/rec/1 これも深く根を張り、非常にしぶとく、複数の除草剤に耐え、胞子でも広がることがある
  三つ葉ルドベキアではなく goutweed: https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/1435/rec/... 細い根が密な網目を作る
  タンポポ: https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/676/rec/2 この例では根が4.5mまで届いている
  ジャガイモ: https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/1014/rec/... トマトを探していて代わりに見つけたものだが、同じ属なので参考になり、塊茎も見える
  ニンジン: https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/1049/rec/... 食用になる直根だけではない
  • ヒルガオの図は、一度見たら忘れられない。抑え込むのにあれほど時間がかかる理由が一目で分かる
  • 地下で植物同士の相性がどれほどよいかを理解するのに役立つかもしれない。例えばタンポポはかなり無害に見える一方で、goutweed は他の植物が入る余地をほとんど残さない
  • タンポポの根が450cmとは、芽を抜いてもまた生えてくるのを防げない理由が説明できる
• 1960年から2009年まで Herr Dipl.-Ing Dr. Erwin Lichtenegger が率いた巨大な仕事を見た。以前からこれらを3D形式に移してみたいと思っていたが、図書館や Pflanzensoziologisches Institute から返事はもらえなかった
  アニメーションにしたら素晴らしいだろうし、今のツールがあったなら、あの偉大な博士がどんなアーカイブを作り上げただろうかと気になる
  長年にわたるこうした努力と献身は珍しく、科学であると同時に芸術作品としてもよく保存されているのはうれしい
  付け加えると、Dr. Santiago Ramon y Cajal の脳ニューロンのワークブックも博物館級の作品で、遠目にはこれらの根と驚くほど似ているところがある
  • 本の価格が200ユーロを超えるのは残念
• タイトルの有効数字がつらい。最後の桁をわざと曖昧にしようと頑張ったように見える
  普通に全桁の 1,18x と書くか、百の位で丸めて 1.2k とすべきだった
  • 1.18k は 1180 より文字数が多い。誰がこんなタイトルを作ったのだろう
  • 最初は図が1030点だったのでタイトルは 1k だった。次に110点追加されてタイトルを変える必要があり、1.1k になった
    さらに42点追加されてタイトルを変える必要があり、1.18k になった
    2週間後にはさらに6点追加される予定なので、またタイトルを変える必要があり、その時は 1.188k に上げられる
• 果実を見たいなら USDA Pomological Collection もある
  https://search.nal.usda.gov/discovery/collectionDiscovery?vi...
• これらの図はどうやって作ったのだろう。正確にやるには、根の周囲の土を非常に小さな塊ごとに慎重に掘り出し、かき乱される前の根系の実際の形を記録するしかなさそうだ
  そうすると、浅い層から深い層までゆっくり観察したうえで、図に見える側面図を再構成する必要があったはずだ
  根を横から見るために2Dのガラス観察容器のようなもので植物を育てると、自然状態とは違う形で根が伸びる可能性が高い
  実際にどうやったのか、とても気になる
• 面白いことに 1.18k は 1180 より文字数が多く、普通 k 表記は 1k のようにあまり正確でない値に使う印象がある
  • 電気工学ではこういう問題はない。1k18 と書けばよい
  • 1.18k は ±5 を示唆するが、1180 は正確に1180を意味する。数が正確でないか、まだ変化し続けているのかもしれない
• だから人々は根本原因分析が単一の根本原因を探すものだと思うのだろう
• 本当に素晴らしく、情報も多い。ただし重要な注意点がある。根が実際にどう成長するかは土壌に大きく左右される
  砂か粘土か、湿度、特に締め固められた層があるか、どこにあるかが大きく影響する
  多くの根系はひどく締め固められた土をまったく突き抜けられないため、かなり変動があると考えたほうがよい
• ある意味では Allen Brain Atlas のニューロン細胞トレーシングデータベースを思い出す
  https://celltypes.brain-map.org/data