Craig Venterが死去
(jcvi.org)- J. Craig Venter, Ph.D. は 2026年4月29日、San Diegoで79歳で死去し、最近診断されたがんの治療中に生じた予期せぬ副作用の後、短期間の入院を経て亡くなった
- Venterは J. Craig Venter Institute の創設者、取締役会会長、最高経営責任者として、現代ゲノミクスを形作り、合成生物学の立ち上がりに影響を与えた
- National Institutes of Healthで expressed sequence tags(ESTs) に基づく遺伝子発見を先駆け、人間ゲノムの最初のドラフト配列と、最初の高品質な二倍体ヒトゲノムの発表を主導した
- Venterとそのチームは、化学的に合成されたゲノムが制御する最初の自己複製細菌細胞を構築し、ゲノムをデジタルで設計し、生きた細胞を駆動するようにブートできることを実証した
- Sorcerer II Global Ocean Sampling Expedition により海洋微生物の多様性を調査し、数百万個の新規遺伝子を発見したと報告したほか、Synthetic Genomics、Human Longevity、Diploid Genomicsも共同設立した
死去と研究所の発表
- J. Craig Venter, Ph.D. は 2026年4月29日、San Diegoで79歳で死去した
- 死因は最近診断されたがんの治療中に生じた予期せぬ副作用であり、短期間の入院後に亡くなった
- Venterは J. Craig Venter Institute の創設者、取締役会会長、最高経営責任者だった
- JCVIのAnders Dale会長は、Venterは違う考え方をし、断固として行動し、まだ存在しないものを作ることで科学は前進すると信じていたと述べた
- JCVIは、ゲノム科学を発展させ、発見を可能にする公共投資を擁護し、知識を実際の影響へと変える幅広い協力を継続していくと述べた
ゲノミクスと合成生物学における役割
- Venterの仕事は現代ゲノミクスを定義することに貢献し、合成生物学分野の立ち上がりにも影響を与えた
- 学際的なチームを作り、大胆なアイデアとより速い方法を推し進め、発見は現実世界での影響につながるべきだという原則を強調した
- 強力な連邦科学予算と、政府・学界・産業界全体の進展を加速する協力を支持した
- キャリアを通じて、ゲノミクスを遅い遺伝子ごとの発見手法から、拡張可能なデータ駆動型科学へと転換することに貢献した
- その後、ゲノムが設計・構築できることを実証する段階にまで研究を拡張した
主な科学的成果
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ESTによる遺伝子発見
- National Institutes of Healthで expressed sequence tags(ESTs) を活用した遺伝子発見の先駆けとなることに貢献した
- ESTアプローチは多数のヒト遺伝子を迅速に特定できるようにし、ゲノムマッピングの取り組みを加速させた
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ヒトゲノムのドラフトと二倍体ゲノム
- ヒトゲノムの最初のドラフト配列を作り上げる作業を主導し、生物学がデジタル時代へ入る契機を作った
- その後、同僚とともに最初の高品質な二倍体ヒトゲノムを発表した
- この成果は、両親の双方から受け継いだ遺伝的変異を捉えることの重要性を示した
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合成ゲノムで駆動する細胞
- Venterとそのチームは、化学的に合成されたゲノムが制御する最初の自己複製細菌細胞を構築した
- この成果は、ゲノムをデジタルで設計し、化学的構成要素から作り、生きた細胞を駆動するように「ブート」できることを実証した
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海洋微生物多様性の調査
- Sorcerer II Global Ocean Sampling Expedition を通じて、メタゲノミクスにより広範な海洋微生物多様性を調査した
- 数百万個の新規遺伝子を発見したと報告し、既知のタンパク質ファミリーの範囲を拡大した
- この研究は、海洋マイクロバイオームとそれが地球システムで果たす役割への理解を広げた
組織と企業の構築
- Venterは、大きな科学的課題に取り組むために設計されたチーム、プラットフォーム、組織を作った人物でもある
- J. Craig Venter Institute を設立し、ゲノミクスと合成生物学研究のための組織基盤を築いた
- 連続起業家として Synthetic Genomics, Inc.、Human Longevity, Inc.、Diploid Genomics, Inc. を共同設立した
- これらの企業活動は、ゲノミクスと合成生物学を健康と社会のためのツールへと転換しようとする取り組みにつながった
JCVIの概要と今後の手続き
- JCVI はMaryland RockvilleとCalifornia La Jollaに所在する非営利研究機関である
- JCVIは、ゲノミクスの発展、社会的含意の理解、研究成果を科学界・一般市民・政策決定者に伝えることに重点を置いている
- 約120人の科学者とスタッフが、合成生物学、ヒトおよび進化生物学、遺伝学、バイオインフォマティクス/インフォマティクス、情報技術、高スループットDNAシーケンシング、ゲノムおよび環境政策研究、科学・科学政策の公共教育の分野で活動している
- JCVIは 501(c)(3) 組織である
- 研究所はVenter家のプライバシー尊重を求めており、追悼に関する追加情報は可能になり次第共有される予定である
1件のコメント
Hacker Newsのコメント
彼と彼の船で一緒にレースをしたことがある。あるときジャイブ中に彼が海へ流され、メインシートが胴体に巻きついた
水中に引きずられながらもどうにか手すりにつかまっていて、私が防水スーツのループ部分をつかんで再び船上へ引き上げることができた
彼は興味深い人物で、ベトナム戦争では衛生兵として従軍し、かつての船 Sorcerer II は2003〜2010年の Global Ocean Sampling Expedition のプラットフォームとなり、数百万の新しい海洋微生物遺伝子を発見した
友人も多く作り、敵もかなりいたが、彼なりの奇妙で驚くべきやり方で、この地球上でひとりの人間として完全な人生を生きたように思える
子どものころ、60 Minutesで彼のインタビューを見た。オリンピックの水泳選手になる夢を諦めて大学を中退し、その後ベトナムで衛生兵として従軍し、海軍艦艇から飛び降りて自殺を図ったが、ほとんどオリンピック級のアスリートだったおかげで生き延びたと語っていた
その後、Cornell Universityで彼の長年の友人である遺伝学者 Andy Clark と一緒にヒトゲノムについて講演する姿を実際に見たが、背が高くて圧倒的な存在感があり、禿げていた
数年後にSan Diegoへ引っ越してサーフィンを始めたのだが、サーフィンのウェブサイトを見ていたら突然Craig Venterが高級時計の広告に出てきた。海でヨットに乗り、当時の私の大学院生活費より高かったに違いない Jaeger-LeCoultre の時計を着けていた
そのさらに数年後、彼の会社のひとつ Synthetic Genomics で面接を受けたが、バイオインフォマティクスのチームは会社の方向転換が多すぎて混乱しているように見えた。バイオ燃料の生産から、人間に移植可能な腎臓を作るためにブタを遺伝子工学的に改変する仕事へ移っていて、数年もしないうちに実際にそのアイデアが動き始めた
結局のところ、Venterとその業績は、私の大人になってからのキャリア全体、つまり生物学・遺伝学・バイオインフォマティクス・機械学習の背景として常に存在していた。偉大な科学を現実にするには、ときに 圧倒的な人格の持ち主 が必要なのだ
記憶が正しければ、彼はSeriusXMとUnited Therapeuticsを作った悪名高い創業者Martin、現在のMartine Rothblattと協業していた
皮肉なことに、彼は人生最後の数年を 寿命延長 に費やしていて[1]、それを払える人々に2万5,000ドルの「先制医療サービス」相談を売っていた[2]
1: 会社のウェブサイト humanlongevity dot com は侵害されているようで、「captcha」と称してトロイの木馬のインストールを誘導する。なので代わりにWikipediaのページを置いておく: https://en.wikipedia.org/wiki/Human_Longevity
2: https://fortune.com/2017/02/21/craig-venter-human-longevity/
Craig Venterは Human Genome Project に関わったことで有名だ。Clinton大統領とFrancis Collinsとともにヒトゲノムの最初のドラフトを発表した
Human Genome Projectの科学者たちは、彼が全体を特許で囲い込み、他の人々に金を払わせようとしていると考えていた。当時は何が特許可能で何が不可能かが明確ではなかった
だから彼の関与は、公的プロジェクトにゲノムアセンブリ競争へ飛び込むよう刺激を与えたことにあり、これは公的側が完全には計画していなかった 巨大な計算問題 だった
https://archive.is/2022.02.14-091753/https://www.nytimes.com...
彼は、非常に慎重な科学者たちが支配していた分野において、良い意味でかなり衝撃的な 起業家であり発明家 だった
もちろんその科学者たちも素晴らしかったが、彼が実現した時点から10〜20年以内にゲノムを解読できていた可能性は低いように思う。文化的には、1980年代のNASAに近い分野で Apollo Project をやったようなものだった
NIH側は、Celeraがゲノムをあまりに速く組み立てるようになるまでプライマーウォーキングに固執し、その後NIHもショットガン方式に加わらざるを得なかった
Craig Venterのご冥福を祈る
小学5年生のときに Human Genome Project の話を聞いたのを覚えている。当時は急進的な試みとして紹介されていた
それから30年たった今、どれほど遠くまで来たか見てほしい。数日前にUK Biobank流出(https://news.ycombinator.com/item?id=47875843)について読んだが、かなりの数の完全なヒトゲノムが流出しているという内容だった。かつて人々がCraig Venterを本当に時代の先を行く人物だと見ていたのも無理はないと思った
悲しい知らせだ。たしか10年ほど前、学会でCraigにほんの短時間だけ会ったことがある
当時の私は遺伝学をほとんど独学で学んでいた程度で、Craigと同じレベルではまったくなかったが、彼はとても積極的に会話に加わり、思慮深く話す時間を取ってくれた
彼は世界的、いや宇宙的レベルの 自己中心的人物 で、最初の二倍体ヒトゲノム配列を発表した。それは彼自身のDNAだった
彼はその業績を人間の聴衆に知らせるだけでは終わらせなかった。「私のゲノムが解読された後、私のソフトウェアは電磁波の形で宇宙に送信され、私の遺伝情報を地球のはるか彼方まで運んだ」と語っていた
彼が残した興味深い発言がある
「
SPIEGEL: それでは、Collinsを本当の科学者とは見ていないのですか？
Venter: ただの政府行政官だと言っておきましょう
」
https://www.science.org/content/blog-post/craig-venter-venti...
全ゲノム配列が発表された当時、私は分子生物学のインターンだった。研究室には サーマルサイクラー があり、紙の予定表に使用時間を予約しなければならなかった
複数のラックにサーマルサイクラーがぎっしり並んだ前に立つ彼の写真を覚えている。彼は規模についてひとつのことを教えてくれたし、ときには目の前にあるものを見て「これを200倍にしたらどうなるだろう」と問う価値があることを証明してみせた
ソフトウェアではGPUアレイのようなものを思えば当然に見えるかもしれないが、ウェットラボと紙の機器予約表に慣れた人間にとっては話が違う。生命科学でも、ときには 力業のスケールアップ が使えるなら、もっと多くのブレークスルーが生まれるのではないかと思う
だが学界にはサンプルサイズがどの程度であるべきかについての固定観念があり、急進的に大きなサンプルを使おうとすると、動物実験の倫理問題から研究費まで、あらゆる障壁にぶつかる
結局、サンプルサイズ12で学べることには限界がある。何も学べない12匹のマウス実験を何度も無駄にすることが、100匹使って最大級の効果量だけでなく実際に識別できる 統計的検出力 を得ることより倫理的だとは思えない