AlphaFold - タンパク質折りたたみ問題のソリューション

 (deepmind.com)
9 ポイント 投稿者 sduck4 2020-12-01 | 2件のコメント | WhatsAppで共有
  • DeepMindが開発した、タンパク質折りたたみ問題を解決するニューラルネットワークモデル

タンパク質折りたたみ問題

  • タンパク質はアミノ酸が鎖状につながり、立体的に折りたたまれた複雑な構造を持つ

  • タンパク質は、それを構成するアミノ酸と折りたたまれた構造に応じて、さまざまな機能を果たす

  • しかし、アミノ酸の配列だけからタンパク質の構造を予測することは非常に難しい

AlphaFold

  • Protein Data Bankの約170,000件のタンパク質構造データと、そのほか構造が判明していないタンパク質データを学習

  • 約128個のTPUv3コアを使用して数週間にわたり学習

CASP(Critical Assessment of protein Structure Prediction)

  • 1994年に初開催された、2年ごとに開かれる世界的なタンパク質構造予測大会

  • まだ構造が判明していないタンパク質の構造を予測

  • AlphaFoldの初期バージョンが2018年に開催されたCASP13に参加

  • 2020年に開催されたCASP14で、AlphaFoldが平均92.4 GDTで1位を獲得

  • これは原子1個分の幅程度の誤差

期待効果と展望

  • 今年、AlphaFoldはORF3a、ORF8などのコロナウイルスタンパク質を予測

  • 今後、さまざまな生物学的問題の解決や新薬開発などに貢献することが期待される

関連記事

2件のコメント

 
ffdd270 2020-12-01

健康管理をしっかりしないといけませんね。寿命延長の夢が実現するまで……今生でやりたいことが多すぎます ;_;
 
xguru 2020-12-01

細胞の老化を巻き戻すのにタンパク質を使うという記事が出ていました。

人工知能が生命延長の夢をかなえるうえで、大きな役割を果たすかもしれませんね。

老化した皮膚細胞を再び若くする「細胞の逆老化」技術が登場

http://m.dongascience.donga.com/news.php?idx=41855

細胞老化を巻き戻す戦略としては、「逆分化」技術が最も広く研究されている。逆分化とは、皮膚細胞のように特定の身体組織へと成長した細胞に、「ヤマナカ転写因子」と呼ばれる4種類のタンパク質を追加し、特定の細胞へ分化する以前の若い状態へ戻す技術だ。